99偷拍视频精品区一区二,口述久久久久久久久久久久,国产精品夫妇激情啪发布,成人永久免费网站在线观看,国产精品高清免费在线,青青草在线观看视频观看,久久久久久国产一区,天天婷婷久久18禁,日韩动漫av在线播放直播

RNAmmer怎么用

這篇文章主要講解了“RNAmmer怎么用”，文中的講解內容簡單清晰，易于學習與理解，下面請大家跟著小編的思路慢慢深入，一起來研究和學習“RNAmmer怎么用”吧！

成都創新互聯公司是專業的張家界網站建設公司，張家界接單;提供網站制作、成都網站制作,網頁設計,網站設計,建網站,PHP網站建設等專業做網站服務;采用PHP框架,可快速的進行張家界網站開發網頁制作和功能擴展;專業做搜索引擎喜愛的網站,專業的做網站團隊,希望更多企業前來合作!

RNAmmer為一款專門的rRNA預測工具，該軟件所使用的隱馬爾科夫模型的訓練數據集選用5S rRNA數據庫和歐洲rRNA數據庫，具有極高的準確率。它既可以用來預測原核生物的5S、16S、23S rRNA，也可以用來預測真核生物的5S、5.8S、18S、28S Rrna，而且是不基于參考序列的從頭預測。

要想下載本地使用需首先在網站填寫姓名、郵箱、機構等信息進行申請，之后會將軟件下載鏈接會發送至郵箱。需要首先安裝  Hmmer  ，然后  RNAmmer  軟件包下載解壓后就可使用。其使用方法如下所示：
rnammer -S bac -m lsu,ssu,tsu -xml out.xml -gff out.gff -h out.hmmreport -f out.rRNA.fasta genome.fasta-S    指定輸入序列的物種所屬的界：古菌arc、細菌bac或真核euk；-m    所需要預測的rRNA種類：'tsu'為5/8s rRNA，'ssu'為16/18s rRNA，'lsu'為23/28s rRNA。如果全部進行預測，則設置為為'tsu,ssu,lsu'；-multi  并行運算，預測正反兩條鏈上所有的rRNA，最多并行運行6個計算，相當于-m lsu,ssu,tsu；-f    生成的rRNA的fasta結果文件名-h    生成的hmm結果報告文件名-gff    生成的rRNA的gff2文件名-xml  生成的xml結果文件名
對細菌基因組序列進行預測，如下所示：
rnammer -S bac -m lsu,ssu,tsu -gff twk.rRNA.gff -f twk.rRNA.fasta -h twk.rRNA.hmmreport new.scaffolds.fasta

在gff和fasta文件中可以看到5S、16S、28S rRNA的預測結果及其序列，如下所示：

RNAmmer怎么用

RNAmmer怎么用

在細菌基因組中，一般  23S rRNA  與  5S rRNA  是緊挨在一起的，而其與  16S 人RNA  之間則隔著較長的序列片段。

感謝各位的閱讀，以上就是“RNAmmer怎么用”的內容了，經過本文的學習后，相信大家對RNAmmer怎么用這一問題有了更深刻的體會，具體使用情況還需要大家實踐驗證。這里是創新互聯，小編將為大家推送更多相關知識點的文章，歡迎關注！

網頁標題：RNAmmer怎么用
網站鏈接：http://www.yijiale78.com/article26/gsohjg.html

成都網站建設公司_創新互聯，為您提供品牌網站設計、響應式網站、網站策劃、定制開發、全網營銷推廣、虛擬主機

廣告

聲明：本網站發布的內容（圖片、視頻和文字）以用戶投稿、用戶轉載內容為主，如果涉及侵權請盡快告知，我們將會在第一時間刪除。文章觀點不代表本網站立場，如需處理請聯系客服。電話：028-86922220；郵箱：631063699@qq.com。內容未經允許不得轉載，或轉載時需注明來源： 創新互聯

h5響應式網站建設