這篇文章將為大家詳細講解有關The Cancer Immunome Atlas數據庫有什么用，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。

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腫瘤免疫療法在多種惡性腫瘤的臨床治療上取得了顯著效果，然而還是存在大部分患者對于免疫療法沒有響應的問題。為了更好的理解腫瘤和免疫細胞相互作用，科學家對來自TCGA和其他幾個大型腫瘤研究項目，共20種實體瘤的NGS數據進行分析，對應文章鏈接如下

https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S2211124716317090

為了更好的查看分析結果，將相關數據整理成了一個數據庫，網址如下

https://tcia.at/

點擊每個腫瘤對應的柱狀圖，可以查看具體的數據，以乳腺癌BRCA為例，結果如下

1. Patients list

列出了每個腫瘤患者的ID, 性別，年齡等信息，示意如下

點擊患者ID, 可以查看詳細的臨床信息，示意如下

2. Gene Expression

對于基因的表達量，提供了以下3種結果

1. gene expression boxplots

2. gene expression heatmaps

3. survival analysis

結果示意如下

3. Cell type Fractions

使用qyanTIseq和Cibersort兩款軟件分析腫瘤患者的免疫細胞組分，結果示意如下

4. GSEA

分析在某種特定的腫瘤中免疫細胞是否富集，結果示意如下

5. Heterogeneity

分析不同腫瘤患者的異質性，結果示意如下

6. Neoantigens

分析腫瘤新抗原，結果示意如下

該數據庫不僅可以查看TCGA中不同腫瘤的分析結果，其分析內容也值得我們借鑒，對于腫瘤樣本的NGS數據， 可以進行基因表達與生存分析的關聯分析，可以進行免疫細胞浸潤分析，新抗原預測等分析內容。

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新聞標題：TheCancerImmunomeAtlas數據庫有什么用
文章鏈接：http://www.yijiale78.com/article6/pcedog.html

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